I documenti di MicroStation sono denominati file DGN. Ogni file DGN è costituito da uno o più modelli, ciascuno dei quali è rappresentato mediante elementi quali linee, archi e forme. La scheda File contiene comandi che consentono di creare, aprire e salvare file DGN. Molte di queste operazioni di gestione dei file, e altre ancora, possono essere eseguite dalla Pagina di lavoro o dalla finestra di dialogo Apertura file.

Non è possibile tenere aperti più file DGN contemporaneamente. Se un file DGN viene aperto quando è già aperto un altro file, quest'ultimo viene chiuso automaticamente.

È comunque possibile visualizzare i modelli contenuti in altri file DGN allegandoli come riferimenti al modello attivo nel file DGN aperto.

Quando si crea un file DGN, MicroStation crea una copia di uno dei modelli o dei file DGN seme forniti nel nuovo file.