As Variáveis de Configuração são organizadas em Variáveis de Configuração de Framework, que começam com o prefixo "_USTN_", e Variáveis de Configuração Operacionais, a maioria das quais começa com o prefixo "MS_". Em geral, as Variáveis de Configuração de Framework são usadas nos arquivos de configuração, enquanto as Variáveis de Configuração Operacionais são usadas para dirigir o comportamento de programa dentro do MicroStation. Algumas Variáveis de Configuração de Framework são determinadas pelo diretório de instalação do MicroStation. Outras Variáveis de Configuração de Framework padronizam para lugares relativos ao diretório de instalação, mas podem ser alteradas nos Arquivos de Configuração fornecidos pelo usuário.