MicroStation può aprire, importare e esportare file nei seguenti formati:

• IGES (Initial Graphics Exchange Specification): un formato file di interscambio di pubblico dominio basato sullo standard ANSI, pensato come standard internazionale per lo scambio di dati di definizione dei prodotti tra diversi sistemi CAD/CAM. Per informazioni specifiche sulla conversione IGES, vedere Scambio di file IGES. Per informazioni sull’esportazione di file IGES conformi alle specifiche di CALS della classe I o II, vedere Esportare i file CALS-conformi IGES.
• Parasolid XMT — un formato file che converte i dati di Parasolid XMT in (importazione) o da (esportazione) un file DGN di MicroStation.
• ACIS SAT — un formato file che converte i dati ACIS SAT in (importazione) o da (esportazione) un file DGN di MicroStation.
• CGM (Computer Graphics Metafile): uno standard ANSI per lo scambio di dati di immagine tra diverse applicazioni grafiche. Lo scambio di file CGM è indipendente dal dispositivo e dall'ambiente.
• STEP AP203/AP214: un formato file che converte i dati STEP AP203 e AP214 in (importazione) o da (esportazione) un file DGN. Le classi 2, 3, 4, 5 e 6 di conformità AP203 sono supportate. Nonostante siano supportate entrambe le versioni DIS e IS di AP203, la versione DIS viene supportata solo per la compatibilità sfondo.
• Ambiente VRML (solo esportazione) — un formato file che converte MicroStation in VRML (Virtual Reality Modeling Language), compreso il posizionamento di collegamenti interattivi fra la geometria nell'ambiente VRML e altre posizioni Internet o ambienti VRML.
• STL (Stereolithography) — un formato file che converte i file STL in (importazione) o da (esportazione) un file DGN di MicroStation.
• DWG & DXF — un formato file che converte file DWG o DXF in (importazione) o da (esportazione) file DGN di MicroStation.
• TerrainModel LandXML (solo importazione) - un formato file che converte i file XML in un file DGN .
• Formati di file immagine (solo importazione) che convertono file JPG, BMP, TIF, GIF, e altri formati in un file DGN.
• Testo (solo importazione) - un formato file che converte i file TXT in un file DGN .
• FBX - un formato file che converte i file FBX in (importazione) o da (esportazione) un file DGN.
• IFC (solo importazione) - un formato file che converte i file IFC (Industry Foundation Classes) in un file DGN.
• SVG (solo esportazione) — un formato file che converte file DGN di MicroStation in SVG (Scalable Vector Graphics).
• OBJ (solo esportazione) — un formato file che converte file DGN di MicroStation in OBJ.
• SketchUp — un formato file che converte file SketchUp (SKP) in (importazione) o da (esportazione) un file DGN di MicroStation.
• Luxology (solo esportazione) - un formato file che traduce un file DGN in un file Luxology (LXO).
• Google Earth (solo esportazione) - un formato file che traduce un file DGN in un file Google Earth (KML).
• Collada (solo esportazione) - un formato file che traduce un file DGN in un file Collada (DAE) perfettamente conforme allo standard Collada 1.4.0.
• U3D (solo esportazione) - un formato file che traduce un file DGN in un file U3D (Universal 3D).
• JT - un formato file che converte dati JT in (importazione) o da (esportazione) un file DGN di MicroStation.
• Acute3D SmartCapture (aperto come di sola lettura; può essere salvato come DGN) — un formato file originario del software Smart3DCapture di fotogrammetria.

I formati file esportati supportano le viste dinamiche. Se si stampa un PDF con vista dinamica 3D o si esporta una vista dinamica in un formato di esportazione 3D come SketchUp o OBJ, i risultati ottenuti corrisponderanno alla vista dinamica. Ad esempio, si consideri una vista dinamica divisa da un piano di sezione in modo che metà del modello sia trasparente. Quando si stampa la vista dinamica in 3D, il PDF risultante corrisponde alla vista dinamica.

Bentley Developer Network offre una serie di convertitori di terze parti per vari formati.

Gli Appunti del sistema, se presenti, possono essere impiegati per lo scambio di dati con altre applicazioni.