Konfigurationsvariablen sind gegliedert in Framework-Konfigurationsvariablen, die mit dem Präfix "_USTN_" beginnen, und Operative Konfigurationsvariablen, die meist mit dem Präfix "MS_" beginnen. Im Allgemeinen werden die Framework-Konfigurationsvariablen in Konfigurationsdateien verwendet, während Operative Konfigurationsvariablen zur Steuerung des Programmverhaltens in MicroStation dienen. Einige Framework-Konfigurationsvariablen werden vom MicroStation-Installationsverzeichnis festgelegt. Andere Framework-Konfigurationsvariablen verweisen standardmäßig auf Speicherorte relativ zum Installationsverzeichnis, können aber in Konfigurationsdateien geändert werden.