MicroStation speichert die aktive Farbe sowie die Farbattribute jedes Elements in der DGN-Datei. Die Farbe für ein Element kann mit Hilfe des Dialogfelds Aktive Farbe definiert werden. Dieses Dialogfeld bietet verschiedene Methoden zur Auswahl einer Farbe, darunter eine Farbtabelle, die eine Farbe als Wert von 0–255 zuweist. Weiterhin können Sie Farben grafisch auswählen, Werte mit Hilfe eines Farbmodells angeben oder eine Farbe aus einem Farbbuch auswählen.

Farben in der geöffneten DGN-Datei können Sie ändern, indem Sie eine andere Farbtabelle anhängen. Die angehängte Farbtabelle wird bei jedem Öffnen der Zeichnungsdatei automatisch aktiviert. Jede der mit MicroStation gelieferten Seed-Dateien ist bereits mit einer Farbtabelle verknüpft.

Die Farbtabellen werden als separate Dateien gespeichert. Die aktive Farbtabelle kann ebenfalls in einer Datei gespeichert werden, so dass sie nach Bedarf an eine beliebige Zeichnungsdatei angehängt werden kann.

Die Farbe kann darüber hinaus Nach Zelle oder „Nach Ebene“ bestimmt werden. Wird die Option "Nach Zelle" gewählt, dann wird beim Platzieren einer Zelle anstelle der Farbe, die bei der Zellenerstellung verwendet wurde, die aktive Farbe herangezogen. Wenn die Option "Nach Ebene" gewählt wird, wird beim Platzieren eines Elements die für die aktive Ebene definierte Farbe zur Darstellung des Elements verwendet.