Quando un file di disegno MicroStation utilizzato come riferimento presenta propri collegamenti, questi diventano riferimenti annidati. I collegamenti fra questi file possono essere mantenuti fra numerosi livelli (profondità) di annidamento, in modo che aprendo un file è possibile visualizzare il contenuto degli altri. I singoli riferimenti possono essere aggiornati e le modifiche vengono visualizzate nel file principale (padre). Quando si collega un riferimento padre al modello e si attiva l'annidamento in diretta, è inoltre possibile controllare quanti livelli di riferimenti annidati sono collegati al modello.

In AutoCAD, esistono due tipi di riferimento che si possono applicare per creare associazioni fra file, collegamenti e sovrapposizioni. Entrambi consentono di visualizzare tutti gli oggetti nel file collegato, nonché quelli nei riferimenti annidati. Nonostante AutoCAD consente i riferimenti annidati in diretta, non fornisce un controllo della profondità di annidamento, quindi tutti i dati dei collegamenti annidati vengono visualizzati in modo implicito.