I flag sono utili per annotare un disegno con promemoria o consigli su modifiche future. Un flag è un'immagine in formato bitmap (elemento raster) con o senza un messaggio descrittivo associato. Sebbene il testo del messaggio non venga visualizzato insieme all'immagine, è possibile rivedere e modificare il testo in una finestra a parte.

Un insieme di file di immagini flag è fornito con la MicroStation nella sua directory immagini, che di default è situata nella ..\Default\Image\ cartella dei programmi di MicroStation.