Im DGN-Dateiformat ist die Anzahl von Ebenen nicht beschränkt, es muss jedoch mindestens eine Ebene vorhanden sein. Nicht verwendete Ebenen können gelöscht werden. Alle Ebenen sind benannt und haben Standardfarben, -strichstärken und -stricharten, die die Basis für zahlreiche Erweiterungen bilden. Ein bedeutender Vorteil des Ebenensystems besteht darin, dass Ebenenstrukturen DGN-dateiübergreifend standardisiert werden können.