Les fichiers DGN 3D se composent d'un cube de dessin dans lequel vous travaillez. Le cube de dessin représente le volume total d'un fichier DGN 3D, dans lequel des points sont définis à l'aide de valeurs x, y et z ou de coordonnées. Des points peuvent être placés n'importe où dans le cube de dessin et ne sont pas limités à un seul plan, comme cela est le cas lorsque vous manipulez un fichier DGN 2D.

Les coordonnées du cube de dessin sont exprimées sous la forme (x,y,z). L'origine globale dans les fichiers prototypes 3D fournis avec MicroStation se trouve exactement au centre du cube de dessin ; elle correspond aux coordonnées (0,0,0). Tout point situé au-dessus de l'origine globale a une valeur Z positive et tout point situé au-dessous a une valeur Z négative.